现在可以选用最优秀的腹腔镜手术，该技术性应用冷光灯出示照明灯具，将腹腔镜手术摄像镜头(直徑为3-1b250m)插进腹部内，应用大数字拍摄技术性使腹腔镜手术摄像镜头拍攝到的图象根据光导纤维传输至后续信号分析系统，而且即时显示信息在专用型监控器上。随后医师根据监控器显示屏上所显示信息病人人体器官不一样视角的图象，对病人的病况开展具体分析，而且应用独特的腹腔镜手术器材开展手术治疗。手术治疗时，只需要在病人腹部开启3个0.5——1cm的小圆孔。
2.用药治疗
用药治疗是根据药品外用口服开展医治，用药治疗相对而言便捷简易，并且无需做手术、不住院治疗、又不容易影响生活起居。便是治疗效果上不足显著，并且存有局限，效果慢，较长的医治周期时间，长期性药品服食对内脏器官损害很大，并且医治不完全。
3.手术医治
而针对很大的子宫卵巢巧克力囊肿则以手术医治为本，防止其因人体健身运动造成缔约扭曲或裂开。此外，避孕药针对防止巧克力囊肿的发作有一定实际效果。
中药治疗可免去手术治疗给病人产生的精神压力，吃药便捷，不做手术，不痛苦，不住院治疗，痛楚风险性小，不影响工作中日常生活。但一样有着较长的医治周期时间，奏效比较慢，并且非常容易出現反复状况和药品造成的别的病发症。
5.开腹手术
卵巢囊肿选用手术医治方式 ，是现阶段普遍的方式 。主要是切除子宫及孑宫内膜异位疾病，保存卵巢。适用45岁下列，无生孕规定，或疾病范畴普遍，没法保存生孕作用者。可是需要开展手术治疗，对病人损害大，影响一切正常生孕，手术费用高。
6.保守治疗
现阶段一般是选用雌激素医治，以抑止雌性激素的生成，促使紊乱子宫内膜委缩，但是针对这些很大的孑宫内膜异位襄肿，这类治疗效果就并不是非常好，因而不建议病人选用这类方式 开展医治。