木瓜酵素（Papain）为存在于木瓜中的一种蛋白质分解酵素，是维持机体正常功能、消化食物、修复组织等生命活动的一种必需物质。木瓜是食物的同时也是植物药，它们具有药食同源的道理。木瓜酵素能帮助消化、吸收，还可以分解蛋白质、糖类及脂肪这三大营养素的植物，尤其是清宿便排肠毒和分解腰腹部脂肪效果显著，这是木瓜酵素的主要功能。
二、食用效果
通便
木瓜酵素能消化分解脂肪和蛋白质，能加强胃肠消化吸收功能；木瓜纤维素酶：分解纤维素，分解结块宿便，帮助消化系统畅通肠道，及时排除毒素。能起到真正清肠排毒和治好便秘作用。
减肥
木瓜酵素不仅可分解蛋白质、糖类，更可分解脂肪，通过分解脂肪可以去除赘肉，缩小肥大细胞，促进新陈代谢，及时把多余脂肪排出体外，同时脂肪分解为脂肪酸，能消化蛋白质，有利于人体对食物进行消化和吸收，脂肪容易堆积在下半身，让腹部多余的脂肪慢慢消失，身材变得苗条起来。
美容
木瓜酵素能促进肌肤代谢，帮助溶解毛孔中堆积的皮脂及老化角质，使肌肤嫩滑细腻，显得更明亮、更清新。木瓜酵素能全面调理长痘肤质，使油性皮肤调理至中性，快速祛除痘痘、粉刺，修复真皮层。
三、误解
作为水果中的一种，木瓜的确含有丰富的营养成分，如木瓜酶、木瓜酵素，维生素C、维生素A。社会上之所以流传有木瓜丰胸的说法，也正是因为木瓜中含有的这些营养成分，尤其是木瓜酶，由于能促进乳腺激素分泌，因此很多人都误认为这就是丰胸了。
但实际上，女性的乳房由乳腺组织、脂肪组织和胸大肌这三部分组成，而乳房的大小也和这三部分有关的。从医学角度来说，乳腺组织发育与雌性激素有关，而与维生素C、维生素A等是没有关系。所以，木瓜中所含的木瓜酵素尤其是维生素A和C等都与乳腺组织无关。