作为一种非常宝贵的重要，灵芝有野生的也有人工养殖的，两种类型的灵芝区别比较大，比如野生灵芝因为没有人工栽培，所以不会受到农药等残害，所以野生灵芝更加宝贵。
1.品种：世界上野生灵芝250多种，目前我国对其中104种已经有了较明确的认识，还有一些品种有待于开发，而养殖的灵芝目前只有5种。野生灵芝即使是在同一种灵芝中、在任何数量下都找不到两个完全相像的，而养殖灵芝从颜色、形状上都非常相像。
2.生长期：野生灵芝，除我国的无柄赤芝为一年生外，大多为子实体多年生植物，有的野生灵芝生长期为数百年，其积累的药用价值更为显著，它神奇的药效为野生灵芝披上了一层神秘的色彩，而养殖灵芝生长期仅有一个月。
3.药效积累：野生灵芝生长期越久药效积累越强。而养殖灵芝的药效是一代不如一代，到了第四代，养殖灵芝的药用价值微乎其微。
4.寄居物：野生灵芝大多寄居于活树干、树皮、木桩或朽木上。
5.繁殖：野生灵芝是担孢子有性遗传，二个雄性一个雌性结合，方能再繁殖成另一个小的野生灵芝。而养殖灵芝是无性遗传。再生长方式是通过菌丝分裂来完成的。
6.形状：野生灵芝无柄的居多，由于品种的不同形状也不尽相同。而养殖灵芝由于品种受限，目前只有一种有柄的灵芝。所以野生灵芝与养殖灵芝比较好区别。
7.农药残留：野生灵芝生长于大自然之中，没有农药及任何有害物质残留，而养殖灵芝一般生长于人工搭建的大棚之中，需要进行防腐、防虫处理，其农药残留就可想而知。
8.有机锗与有机硒：灵芝中最有价值的有机锗和有机硒在养殖灵芝中根本不含。每一克野生灵芝中含有机锗800至2000微克，含有机硒1000至4000微克。是生长二十年野山参中有机硒含量的4-6倍。
9.灵芝多糖、灵芝酸、总三萜及大量的微量元素：野生灵芝中灵芝多糖及灵芝酸的含量是养殖灵芝的三到六倍。而总三萜及大量的微量元素在养殖灵芝中的含量也远不如野生灵芝。